Symulator GLEAMviz

Symulator GLEAMviz to aplikacja klient-serwer z wykorzystaniem modelu GLEAM, przeznaczona dla epidemiologów i decydentów do analizowania zagrożeń pandemicznych, prognozowania ich rozwoju oraz jako pomoc w sprostaniu wyzwaniom związanym z opracowaniem strategii interwencyjnych minimalizujących ich skutki.

GLEAM to stochastyczny model metapopulacyjny, korzystający z trzech fundamentalnych warstw: warstwa populacji, warstwa mobilności i warstwa choroby. Populacja świata dzieli się na ponad 3200 subpopulacji skoncentrowanych wokół głównych węzłów transportu lotniczego: warstwa populacji wykorzystuje dane z projektu Gridded Population of the World realizowanego przez SEDAC (https://sedac.ciesin.columbia.edu/data/collection/gpw-v4). Te obszary spisów ludności są wzajemnie powiązane poprzez dwie różne sieci mobilności; mobilność dalekiego zasięgu korzysta z danych dotyczących pasażerów linii lotniczych, pozyskanych z OAG, a mobilność bliskiego zasięgu między regionami sąsiadującymi jest symulowana z wykorzystaniem danych dotyczących dojazdów. W każdej subpopulacji dynamika choroby bazuje na koncepcji modelowania kompartmentowego: rozwój epidemii jest determinowany przez równania opisujące przemieszczanie się osób między różnymi kompartmentami.

Model GLEAM jest rozszerzany na różne sposoby, na przykład poprzez zintegrowanie go ze szczegółowym programowaniem agentowym na poziomie kraju, oraz jest wykorzystywany i walidowany w wielu scenariuszach rzeczywistych, zaczynając od pandemii grypy H1N1 w 2009 roku. Korzystając z symulatora GLEAMviz, można przeprowadzić analizę scenariuszy i oszacować efektywność różnych strategii powstrzymywania.

Klient GLEAMviz umożliwia użytkownikom projektowanie symulacji epidemii chorób zakaźnych z wysokim poziomem elastyczności. Dostępna jest możliwość definiowania złożonej kompartmentalizacji i wprowadzania parametrów przejścia w ustrukturyzowany sposób, a następnie po określeniu warunków początkowych można przeprowadzić symulację rozwoju pandemii z oszacowaniem istotnych ilości, takich jak częstotliwość występowania, czas inwazji itp. Narzędzie umożliwia symulowanie różnych strategii ograniczania skutków, takich jak stosowanie leków lub szczepień, oraz porównanie przewidywanego rozwoju ze scenariuszem bazowym.