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Un simulateur réaliste de la diffusion de l'agent pathogène et des vagues pandémiques, sur la base d'un modèle stochastique de méta-population du nom de GLEAM, utilisant des données réelles de recensement et de mobilité.

Le simulateur GLEAMviz est une application client-serveur mettant en place le modèle GLEAM visant à être utilisé par des épidémiologistes et décideurs politiques pour analyser les risques pandémiques, prévoir leur évolution et aider à faire face aux défis rencontrés dans le développement de stratégies d'intervention minimisant leur impact.

GLEAM est un modèle stochastique de méta-population utilisant trois couches fondamentales, la couche population, la couche mobilité et la couche maladie. La population mondiale est divisée en plus de 3200 sous-populations axées sur les plaques tournantes du transport aérien : la couche population utilise les données du projet Gridded Population of the World de SEDAC (https://sedac.ciesin.columbia.edu/data/collection/gpw-v4). Les régions recensées sont interconnectées par deux différents réseaux de mobilité : la mobilité longue portée utilise des données sur les passagers de compagnies aériennes recueillies par OAG, alors que la mobilité à courte portée entre les régions avoisinantes est simulée à l'aide des données de transport. Dans chaque sous-population, la dynamique de la maladie utilise une approche de modélisation compartimentalisée : l'évolution de l'épidémie est déterminée par des équations décrivant la transition des individus entre différents compartiments.

Le modèle GLEAM a été étendu de différentes manières, par exemple en l'intégrant avec des modèles basés sur les agents au niveau national et a été utilisé et validé dans de nombreux scénarios réels, à partir de la du H1N1 en 2009. En utilisant le simulateur GLEAMviz, il est possible d'analyser les scénarios et d'estimer l'efficacité de différentes stratégies de confinement.

Le client GLEAMviz permet aux utilisateurs de concevoir des simulations de l'éclosion de maladies infectieuses avec un haut niveau de flexibilité. Il est possible de définir des compartimentations complexes et de saisir les paramètres de transition de manière structurée, puis, en spécifiant les conditions initiales, il est possible de simuler l'évolution d'une pandémie en estimant les quantités pertinentes comme l'incidence, le délai d'invasion, etc. L' permet de simuler différentes stratégies d' , par ex. l'utilisation de médicaments ou de vaccins, et de comparer l'évolution prévue avec le scénario de base. 

Supported Use Cases

Modelling the outbreak of a new COVID-19 strain in the Valencia region

GLEAM will be used as a predictive modelling tool for the simulation of the outbreak of a new COVID-19 strain in the Valencia region, in particular by providing information about the spreading of the disease to other regions in Spain. The output obtained from the simulations will represent the median value and 95% confidence interval related to the daily fractions of new and cumulative transitions (e.g., latent, infectious, recovered individuals) at different geographic levels, and possibly given for each age group separately. Moreover, invasion tree data will also be generated when required.

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Illustrations
Logo GLEAMviz
Exemple tableau de bord GLEAMviz
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